Walaupun aplikasi yang sesuai dengan klasifikasi aplikasi super boleh menawarkan pengguna pelbagai jenis perkhidmatan berbanding alternatif satu guna, pengawal selia internet di wilayah seperti AS dan Eropah telah menjadi lebih kritikal tentang kuasa keseluruhan industri teknologi dan telah menjadi lebih kritikal terhadap syarikat yang membangunkan aplikasi sedemikian. Di China, WeChat dan firma tempatan lain telah diarahkan untuk membuka platform mereka kepada persaingan oleh pengawal selia tempatan.[21]

Terdapat juga laporan yang mencadangkan bahawa mungkin sukar untuk meniru model aplikasi super WeChat. Ini sebahagiannya berpunca daripada kemuncak kadar penembusan telefon pintar di banyak wilayah di seluruh dunia, yang telah membawa kepada kedai aplikasi yang terlalu sesak dan sekatan yang lebih ketat ke atas pengiklanan yang disasarkan apabila pengawal selia menegaskan lebih banyak kawalan ke atas syarikat. Dari sudut pandangan teknikal, aplikasi satu guna secara perbandingan lebih pantas, lebih responsif dan lebih mudah untuk dinavigasi berbanding aplikasi super, yang membantu meningkatkan pengalaman pengguna secara keseluruhan.[22] Apl super juga lebih cenderung untuk menyimpan jumlah data peribadi yang lebih besar untuk memudahkan penyampaian perkhidmatan mereka dan pengguna menghadapi risiko yang lebih besar untuk menjadi mangsa pencerobohan data yang teruk. Pada tahun 2020, perkara ini berlaku dengan Tokopedia, apabila data 91 juta pengguna dicuri dan dikongsi oleh penggodam.[3]

Ia juga telah diperhatikan bahawa pengguna yang kehilangan akses kepada akaun mereka atau diharamkan daripada aplikasi super biasanya kehilangan akses kepada berbilang perkhidmatan dunia nyata dan aplikasi digital.[23]

Pada Oktober 2022, aplikasi super Korea Selatan KakaoTalk mengalami gangguan selama beberapa hari berikutan kebakaran di pusat data yang menyebabkan kelembapan ekonomi akibat penggunaannya dalam ekonomi Korea secara keseluruhan.[24]